Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sypl2O89104 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sypl2O89104 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms