Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apaf1O88879 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Apaf1O88879 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apaf1O88879 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms