Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CcnkO88874 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcnkO88874 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms