Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JtbO88824 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JtbO88824 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JtbO88824 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JtbO88824 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JtbO88824 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JtbO88824 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JtbO88824 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JtbO88824 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms