Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd7O88665 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd7O88665 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd7O88665 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms