Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp6O88572 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp6O88572 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp6O88572 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp6O88572 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp6O88572 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp6O88572 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp6O88572 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp6O88572 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp6O88572 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms