Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnmt3bO88509 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnmt3bO88509 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms