Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnmt3aO88508 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnmt3aO88508 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms