Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nid2O88322 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nid2O88322 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nid2O88322 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nid2O88322 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nid2O88322 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nid2O88322 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nid2O88322 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms