Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srpk1O70551 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srpk1O70551 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms