Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lnx1O70263 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms