Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChadO55226 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChadO55226 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChadO55226 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChadO55226 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChadO55226 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChadO55226 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChadO55226 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChadO55226 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChadO55226 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ChadO55226 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChadO55226 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChadO55226 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChadO55226 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ChadO55226 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms