Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Supt5hO55201 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Supt5hO55201 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Supt5hO55201 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms