Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlkO54988 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlkO54988 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlkO54988 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SlkO54988 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlkO54988 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlkO54988 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SlkO54988 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SlkO54988 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SlkO54988 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SlkO54988 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SlkO54988 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SlkO54988 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SlkO54988 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SlkO54988 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SlkO54988 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SlkO54988 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SlkO54988 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SlkO54988 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SlkO54988 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SlkO54988 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SlkO54988 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SlkO54988 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms