Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TsksO54887 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TsksO54887 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TsksO54887 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsksO54887 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsksO54887 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsksO54887 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TsksO54887 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsksO54887 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsksO54887 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsksO54887 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsksO54887 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TsksO54887 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TsksO54887 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TsksO54887 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TsksO54887 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TsksO54887 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsksO54887 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TsksO54887 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TsksO54887 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TsksO54887 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TsksO54887 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TsksO54887 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TsksO54887 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TsksO54887 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TsksO54887 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsksO54887 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsksO54887 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsksO54887 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsksO54887 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TsksO54887 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TsksO54887 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms