Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Atp10aO54827 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp10aO54827 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp10aO54827 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp10aO54827 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp10aO54827 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms