Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Timm44O35857 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Timm44O35857 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timm44O35857 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Timm44O35857 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timm44O35857 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms