Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc1a6O35544 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc1a6O35544 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms