Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch2O35516 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Notch2O35516 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Notch2O35516 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms