Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atf6bO35451 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Atf6bO35451 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Atf6bO35451 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atf6bO35451 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atf6bO35451 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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