Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Abcc1O35379 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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Abcc1O35379 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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Abcc1O35379 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc1O35379 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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Abcc1O35379 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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Abcc1O35379 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
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Abcc1O35379 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
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