Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc18a3O35304 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc18a3O35304 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc18a3O35304 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms