Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkd2O35245 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms