Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcns1O35173 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms