Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr1aO35134 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr1aO35134 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr1aO35134 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms