Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ArxO35085 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ArxO35085 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ArxO35085 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ArxO35085 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ArxO35085 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ArxO35085 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ArxO35085 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ArxO35085 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArxO35085 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArxO35085 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ArxO35085 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArxO35085 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArxO35085 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArxO35085 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArxO35085 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArxO35085 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArxO35085 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArxO35085 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArxO35085 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArxO35085 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArxO35085 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArxO35085 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArxO35085 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms