Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sypl1O09117 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sypl1O09117 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms