Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfil3O08750 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfil3O08750 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nfil3O08750 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfil3O08750 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms