Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MttpO08601 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MttpO08601 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MttpO08601 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MttpO08601 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MttpO08601 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MttpO08601 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MttpO08601 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MttpO08601 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MttpO08601 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MttpO08601 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MttpO08601 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MttpO08601 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MttpO08601 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MttpO08601 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MttpO08601 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MttpO08601 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MttpO08601 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MttpO08601 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MttpO08601 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MttpO08601 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MttpO08601 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms