Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20939L7N243 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms