Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21310J3QQ23 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm21310J3QQ23 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm21310J3QQ23 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm21310J3QQ23 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm21310J3QQ23 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm21310J3QQ23 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm21310J3QQ23 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21310J3QQ23 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21310J3QQ23 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21310J3QQ23 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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