Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3099J3QPA5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms