Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21797J3QNW5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21797J3QNW5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms