Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a18J3QN01 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms