Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc179J3QM76 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms