Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6594J3QM43 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm6594J3QM43 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms