Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z7

Vmn2r75, MCG3425, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r75G5E8Z7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r75G5E8Z7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r75G5E8Z7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms