Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn20G5E8X0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn20G5E8X0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn20G5E8X0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn20G5E8X0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cldn20G5E8X0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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