Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubgcp6G5E8P0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubgcp6G5E8P0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms