Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf148G3X9R7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf148G3X9R7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms