Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3G3X939 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc9a3G3X939 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms