Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim55G3X8Y1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim55G3X8Y1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms