Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34aG3UW52 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms