Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r76F8VQ63 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms