Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6F8VPZ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6F8VPZ5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ercc6F8VPZ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms