Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9yF8VPU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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