Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28038F7BCN9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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