Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5861F6VCN9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms