Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21977F6U3N7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms