Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf4E9QAP7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf4E9QAP7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms